IN ENGLISH BELOW 

Tule tutkijaksi Pohjois-Savoon!

Kuopion yliopistollisessa sairaalassa Pohjois-Savon hyvinvointialueella on avoinna vuoden mittainen projektitutkijan tehtävä, joka on mahdollista laajentaa väitöskirjahankkeeksi. Hanke keskittyy koneoppimiseen, kuva-analyysiin ja rekisteritutkimukseen osteoporoosin ja murtumariskin tutkimuksessa. Tehtävä sijaitsee Kuopiossa. Tutkimus tehdään pääosin Kuopion yliopistollisessa sairaalassa, mutta tutkija voi työskennellä osan viikosta Itä-Suomen yliopistossa, ja mahdollinen väitöskirja tehdään Itä-Suomen yliopistoon (UEF).

Tutkimusprojektin kuvaus

Tutkija työskentelee Suomen Akatemian ja Pohjois-Savon hyvinvointialueen rahoittamassa tutkimushankkeessa. Hankkeessa kehitetään uusia teknologisia, laskennallisia sekä kone‑ ja syväoppimiseen perustuvia analyysimenetelmiä osteoporoosin diagnostiikkaa ja murtumien ennustamista varten. Hankkeessa tutkija kehittää syvällisen osaamisen koneoppimisessa, kuvantamisen analyysissä, potilasrekisteriaineistojen analyysissä sekä potilasmittaustekniikoissa. Projektilla on käytössään laaja potilasaineisto, joka kattaa useita kuvantamistekniikoita (TT, MRI, DXA ja röntgen). Lisäksi käytössä on myös potilasrekisteritiedot, mukaan lukien potilasdiagnoosit, radiologiset lausunnot, sairaalakäyntitiedot sekä muut potilasasiakirjat. Tutkimushankkeen tavoitteena on viedä kehitetyt data- ja kuva-analyysimenetelmät kliiniseen käyttöön tukemaan kliinikkoja heidän päivittäisessä työssään osteoporoosin diagnostiikassa ja murtumariskin arvioinnissa. Tutkimusprojekti on luonteeltaan monitieteinen ja yhdistää lääketieteellisen fysiikan, teknologian, terveysinformatiikan sekä kliinisen radiologian ja fysiologian osa-alueita. Tämä tutkimushanke on erinomainen tilaisuus akateemisesta urasta kiinnostuneelle sekä sairaalafyysikon uraa tavoittelevalle. Väitöskirjatyön ohella tehtävään valittu tutkija voi ohjata kandidaatti‑ ja maisteri-/diplomi-insinööriopiskelijoita sekä osallistua opetustyöhön.

Tutkimusryhmässä aiemmin tehdyn tutkimuksen pohjalta tämän projektin ensimmäinen tehtävä keskittyy murtumien automaattiseen havaitsemiseen röntgenkuvista. Projektin mahdolliset tulevat tehtävät voidaan muodostaa tehtävään valitun tutkijan aiemman osaamisen ja mielenkiinnon perusteella. Osa-alueita ovat:

• Potilaskuvien ja muiden potilasaineistojen analysointi tekoälyn ja koneoppimisen menetelmillä
• Suurten potilaskuva- ja data-aineistojen käsittely
• Koneoppimismenetelmien vieminen osaksi lääkärien kliinistä työtä
• Uusien lääketieteellisten potilasmittausmenetelmien ja laitteiden kehittäminen
• Potilasmittausten parissa työskentely

Tehtävät

• Koneoppimismenetelmien kehittäminen ja tutkiminen
• Suurten potilasaineistojen analysointi: useita satoja tuhansia potilaita, miljoonia kuvia ja 100 miljoonaa rekisterimerkintää
• Osallistuminen potilasmittauksiin ja tulosten raportointiin
• Tieteellisten artikkeleiden kirjoittaminen
• Mikäli kiinnostunut väitöskirjaprojektista, ulkopuolisen rahoituksen ja apurahojen hakeminen väitöskirjaprojektin rahoituksen turvaamiseksi
• Mahdollisuus opetus- ja ohjaustehtäviin
• Kansainvälinen tieteellinen yhteistyö sekä mahdollisuus muutaman kuukauden mittaiseen vierailuun ulkomaiseen tutkimuslaboratorioon

Vaatimukset ja eduksi luettavat tiedot/taidot:

• Soveltuva ylempi tiedekorkeakoulututkinto tai valmistuminen lähitulevaisuudessa: FM, DI tietojenkäsittelytieteessä, lääketieteellisessä fysiikassa, lääketieteellisessä tekniikassa, biolääketieteen tekniikassa tai muulla soveltuvalla alalla
• Kokemusta neuroverkkojen kanssa työskentelystä
• Ohjelmointitaidot (Python, Matlab) sekä relaatiotietokantojen ja SQL:n tuntemus luetaan eduksi
• Kokemus lääketieteellisten kuvantamisaineistojen analysoinnista luetaan eduksi
• Sujuva kirjallinen ja suullinen englannin kielen taito
• Kyky työskennellä monialaisessa kansainvälisessä tiimissä sekä hyvät yhteistyötaidot

Työympäristö

Tutkija työskentee Kuopion yliopistollisessa sairaalan Kuvantamiskeskuksessa sekä Teknillisen Fysiikan laitoksella Itä-Suomen yliopistossa. Sairaalan ja yliopiston tutkimusinfra on projektin käytössä. Jos hankkeen haluaa laajentaa väitöskirjaprojektiksi, valittavan tutkijan tulee olla kelpoinen jatko-opintoihin Itä-Suomen yliopistossa ja hakeutua tiedekunnan LUMETO-tohtoriohjelmaan. Tutkija työskentelee tiiviissä yhteistyössä Biofysiikan ja Kuopio Musculoskeletal Research Unit (KMRU) -tutkimusryhmien kanssa osana Tuki- ja liikuntaelimistön terveys ja teknologia -tutkimusyhteisöä. Työnantajana toimii Pohjois-Savon hyvinvointialue kilpailullisen tutkimusrahoituksen kautta. Tutkimus on osa laajempaa kansainvälistä tutkimusyhteistyötä. Tutkimusyhteistyöhön kuuluvissa ryhmissä tehdään maailmanlaajuisesti arvostettua osteoporoosin ja murtumariskin diagnostiikan parantamiseen liittyvää tutkimusta.

Paikka täytetään heti, kun oikea ehdokas löytyy. Otamme vastaan hakemuksia (sis. CV:n, 1-2 sivun motivaatiokirjeen, mahdollisen julkaisuluettelon ja opintorekisterit)  tämän työpaikkailmoituksen kautta.

Tutkijan palkka projektin alussa on 2 800 €/kk. Tehtävän kesto on ajalle 1.8.2026 (tai sopimuksen mukaan) – 30.8.2027 tehtävän projektiluontoisuuden vuoksi. Lisärahoitusta haetaan aktiivisesti projektin jatkamiseksi, ja tutkijaa tuetaan apuraha- ja rahoitushakemusten laatimisessa tulevan rahoituksen varmistamiseksi. Tehtävän mahdollisesta jatkosta sovitaan erikseen. Projektissa noudatetaan koeaikaa (maksimissaan kuusi (6) kuukautta)

Tule mukaan tekemään hyvää Pohjois-Savon hyvinvointialueelle!

IN ENGLISH

Become a researcher in North Savo!

A one year project researcher position that can be broadened to a PhD project is available at Kuopio University Hospital in the Wellbeing Services County of North Savo. The project covers machine learning, image analysis, and patient register analysis in osteoporosis and fracture risk research. The position is in Kuopio, Finland. The research is conducted mainly at the Kuopio University Hospital, but the researcher can work part of the week at the University of Eastern Finland (UEF) and the PhD dissertation is made for UEF.

Description of the project

The researcher will work on a research project funded by the Research Council of Finland and the Wellbeing Services County of North Savo. The project aims at developing new technological, computational, and machine/deep learning-based solutions for the diagnosis of osteoporosis and predicting future fractures. In the project, the applicant will develop an in-depth understanding of machine learning, image analysis, patient register analysis, and patient measurement techniques. The project has a large patient image dataset covering multiple imaging modalities (CT, MRI, DXA and X-ray) collected from several hospitals. In addition, the project has access to patient register data, including patient diagnoses, radiological reports, hospital visit information, and other patient records. The aim of the whole project is to implement the developed analysis methods in clinical workflow to support clinicians in their daily work related to the diagnostics of osteoporosis and fracture risk assessment. The project is multidisciplinary, intrinsically combining parts from medical physics, technology, health informatics, and clinical radiology and physiology. This research project is an excellent opportunity for those interested in an academic career or aiming for a career as a medical physicist. Alongside a PhD project, it may be possible to supervise BSc and MSc and participate in teaching.

Following previous research conducted within the research group, the first task within this project is concentrated on the automatic detection of fractures in X-ray images. Possible future tasks of the project can be tailored based on the applicant's previous experience and preferences. The project tasks include:

• Machine and deep learning-based data and image analytics
• Exploring large patient image and register datasets
• Integrating machine learning techniques to clinical workflow
• Developing and testing medical devices and novel measurement techniques
• Working with patient measurements

Expected tasks

• Developing and investigating machine learning methods
• Analyzing large patient datasets with a few hundred thousand patients, millions of images and 100 million register records
• Participating in patient measurements and reporting of results
• Writing scientific articles
• If interested in pursuing a PhD degree, applying for external funding and grants to secure funding for the rest of the PhD project
• Possibility for teaching and supervision duties
• Global scientific collaboration with the possibility for a few months’ visit to a research laboratory abroad

Requirements 

• A suitable higher education university degree or graduation in the near future: MSc, MSc (Technology) in computer science, medical physics, medical technology, biomedical engineering, or other applicable field, or graduation soon
• Experience in neural networks is required
• Programming skills (Python, Matlab) and knowledge of relational databases and SQL are beneficial
• Experience of medical imaging data analysis is beneficial
• Fluency in written and spoken English
• The capability to work in a multidisciplinary international team and good collaboration skills

Working environment

The work will be conducted at Kuopio University Hospital in the Diagnostic Imaging Center and at the Department of Technical Physics in University of Eastern Finland. Hospital’s and university’s research infrastructure are available for the project. Recruited PhD candidate shall be qualified to pursue postgraduate studies at the University of Eastern Finland by enrolling in the Faculty's Doctoral Programme LUMETO. Researcher will work in close collaboration with Biophysics and Kuopio Musculoskeletal Research Unit - KMRU research groups within the Musculoskeletal Health and Technology research community. The Wellbeing Services County of North Savo (Pohjois-Savon hyvinvointialue) will be the employer via competitive research funding. The research will be a part of a larger international research collaboration. The research groups belonging to this collaboration conduct globally well-renowned research related to improving the diagnostics of osteoporosis and fracture risk.

The position is filled immediately when the right candidate is found. We accept applications (incl. CV, 1–2-page motivation letter, possible list of publications, and study records) via this recruitment announcement. 

The salary at the beginning of the project is approx. 2800 €/month. The duration of the fixed-term assignment is from 1.8.2026 (or as agreed) until 30.8.2027 due to it pertaining to a specific project task. Additional funding is actively applied to continue the project, and the successful candidate will also be supported in writing grant applications to secure future funding. Continuation of the position will be agreed separately. In the project, we follow a trial period (max. six (6) months)

Come and do good for the welfare area of North Savo!